Biyoloji Eğitiminde Kullanılabilecek Yapay Zekâ Araçları

0

BEĞENDİM

ABONE OL

News

0

UCSF ChimeraX: Biyolojik yapıların görselleştirilmesi, analizi ve modellemesi için kullanılan bir programdır. Bu program, proteinler, DNA ve RNA gibi biyomoleküllerin yapısını ve etkileşimlerini incelemek için kullanılır.

PyMOL: Biyomoleküllerin yapısını ve etkileşimlerini görselleştirmek için kullanılan bir moleküler modelleme programıdır. Bu program, proteinlerin 3 boyutlu yapısını incelemek ve analiz etmek için yaygın olarak kullanılır.

VMD (Visual Molecular Dynamics): Moleküler dinamik simülasyonları görselleştirmek ve analiz etmek için kullanılan bir programdır. Bu program, proteinlerin ve diğer biyomoleküllerin hareketlerini ve etkileşimlerini simüle etmek için kullanılır.

CHARMM (Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics): Biyomoleküllerin yapısını ve dinamiklerini modellemek için kullanılan bir programdır. Bu program, proteinlerin ve diğer biyomoleküllerin simülasyonları için kapsamlı bir araç seti sunar.

Genetik Analiz Araçları: Genetik analiz ve veri işleme yazılımları, genetik verileri analiz etmek ve yorumlamak için kullanılır. Bu araçlar, öğrencilerin genetik konuları daha iyi anlamalarına yardımcı olur.

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool): Bir DNA veya protein dizisini veri tabanındaki diğer dizilerle hızlı bir şekilde karşılaştırmak için kullanılan bir araçtır. Bu sayede, diziler arasındaki benzerlikleri ve evrimsel ilişkileri belirlemek mümkün olur.

ClustalW: Çoklu dizi hizalaması yapmak için kullanılan bir programdır. Bu program, birçok farklı organizmadan elde edilen DNA veya protein dizilerini hizalamak ve benzerlikleri analiz etmek için kullanılır.

EMBOSS: EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite), biyolojik dizilerle çalışmak için bir dizi araç sunan yazılım paketidir. Bu araçlar; dizileri analiz etmek, hizalamak ve manipüle etmek için kullanılır.

Geneious: DNA ve protein dizilerini analiz etmek, editlemek ve karşılaştırmak için kullanılan güçlü bir araçtır. Genetik mühendislik ve biyoinformatik çalışmalarında yaygın olarak kullanılmaktadır.

SnapGene: Moleküler biyoloji ve genetik araştırmaları için tasarlanmış bir yazılımdır. PCR, klonlama ve dizi analizi gibi işlemleri kolayca yapmanıza olanak tanır.

CLC Genomics Workbench: Genomik ve transkriptomik verileri analiz etmek için kullanılan bir yazılımdır. DNA, RNA ve protein dizilerini analiz etmek ve yorumlamak için bir dizi araç sunar.

BioEdit: DNA, RNA ve protein dizilerini analiz etmek ve düzenlemek için kullanılan ücretsiz bir programdır. Basit ve kullanıcı dostu arayüzüyle öğrencilerin, genetik konuları anlamalarına yardımcı olur.

NCBI GenBank: Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi’nin (NCBI) sunduğu GenBank veri tabanı; gen dizileri, genomlar ve diğer genetik verileri araştırmak ve analiz etmek için kullanılır.

Öğrenciler genetik verileri gerçek dünya uygulamalarıyla ilişkilendirmek için bu veri tabanını kullanabilirler.

Avogadro: Ücretsiz ve açık kaynaklı olan Avogadro, moleküler yapıları ve kristal yapıları modellemek için kullanılır. Moleküler dinamik simülasyonlar yapabilir ve moleküler özellikleri hesaplayabilir.

PyMOL: Biyokimyacılar ve yapısal biyologlar için tasarlanan PyMOL, proteinlerin ve diğer biyomoleküllerin 3 boyutlu yapılarını görselleştirmek için kullanılır. Yapısal biyoloji alanında yaygın olarak kullanılan bir yazılımdır.

VMD (Visual Molecular Dynamics): Moleküler dinamik simülasyonları ve moleküler yapıların analizini yapmak için kullanılan bir yazılımdır. Proteinler, nükleik asitler ve lipidler gibi biyolojik sistemleri modellemek için kullanılır.

Gaussian: Moleküler yapılardan elektron dağılımlarına kadar çeşitli kuantum kimyasal hesaplamaları yapmak için kullanılan bir programdır. Bu program, kimya alanında teorik hesaplamalar için yaygın olarak kullanılır.

CHARMM (Chemistry at HARvard Molecular Mechanics): Protein ve diğer biyomoleküllerin yapılarını ve etkileşimlerini modellemek için kullanılan bir moleküler modelleme ve simülasyon yazılımıdır. Biyofizik ve yapısal biyoloji alanlarında sıkça kullanılır.

Özetle biyoloji eğitiminde YZ araçları, öğrencilerin yaşamın temel prensiplerini anlamalarını ve biyolojik sistemlerle etkileşime geçmelerini destekleyebilir (Amorim vd., 2004; Lindner & Berges, 2020). Öğrenciler simülasyonlar, görselleştirmeler ve interaktif öğrenme

platformları aracılığıyla biyolojik kavramları daha iyi kavrayabilirler (Lee vd., 2022; Lindner & Berges, 2020). YZ’nin biyoloji öğretimine entegrasyonu, öğrencilerin doğal dünyayı anlama yeteneklerini güçlendirmek ve bilimsel düşünme becerilerini geliştirmek için önemli bir fırsat sunabilir.

YAPAY ZEKÂ İLE EĞİTİMDE YENİ BİR DÖNEM

Günümüzde teknoloji, eğitim dünyasında devrim yaratmaktadır. Yapay zekâ (YZ) gibi yenilikçi teknolojiler, öğretmenlerin sınıflarında ve öğrencilerin öğrenme süreçlerinde önemli bir rol oynamaya başlamıştır (Humble & Mozelius, 2019; Kaplan-Rakowski vd., 2023). Bu kitap, YZ araçlarını öğretmenler için bir rehber olarak sunmayı amaçlamaktadır. Eğitimde YZ’nin kullanımı, Türkçe derslerinden fen bilimlerine, matematikten özel eğitime kadar geniş bir yelpazede değerlendirilmektedir. Öğretmenler, öğrencilerinin öğrenme deneyimlerini zenginleştirmek ve öğretim yöntemlerini iyileştirmek için YZ’nin potansiyelinden faydalanabilirler (Celik vd., 2022; Kolchenko, 2018).

Kaynak: T.C. MİLLÎ EĞİTİM BAKANLIĞI • Yenilik ve Eğitim Teknolojileri Genel Müdürlüğü • EĞİTİMDE KULLANILAN YAPAY ZEKÂ ARAÇLARI • Öğretmen El Kitabı